Potrebbe dipendere dalle impostazioni del bios...
Anche io notai dopo l'installazione di Ubuntu 10.04 64bit
una velocità massima di soli 9mb\s in scrittura da HD ext4 (SSD da 220mb\s) a usb (HD ntfs da 640gb 7200rpm) e in lettura di poco superiore.

Ho risolto dal bios togliendo la spunta all'opzione legacy usb support (in altri bios forse dovresti specificare usb high speed al posto full speed )
a me ha funzionato egregiamente, spero di essere stato di aiuto.

Giovanni