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Qualcuno ha idea del perchè il mio puntatore del mouse, da quando ho installato i driver nvidia (pacchetto nvidia-glx e script nvidia-xconfig con opzioni

RenderAccel
AllowGLXWithComposite
AddARGBGLXVisuals
NoLogo

il puntatore del mouse "lampeggia" tutte le volte che visualizza un animazione? O_ò
Non so più dove sbattere la testa

Hai controllato il refresh?
Poi sei sicuro che non ci siano conflitti tra nvidia-glx e nvidia-xconfig?

Conflitti tra nvidia-glx e nvidia-xconfig non credo... mi faceva la stessa cosa seguendo le wiki e modificando a mano lo xorg.conf, così ho provato con l'nvidia-xconfig sperando che risolvesse il problema, ma niente.

Cosa intendi per refresh? se ti riferisci a quello del monitor è a posto, e l'unica cosa che "tremola"/lampeggia è il puntatore del mouse, e solo quando mostra un animazione: tutto il resto si vede perfettamente

Sì per refresh intendevo quello del monitor, poi AllowGLXWithComposite e AddARGBGLXVisuals, sai già se sono supportate dalla tua scheda video?
Il glx è già abilitato? intendo dire hai già dato da terminale sudo nvidia-glx-settings  enable?

Teoricamente la mia scheda le supporta ma nel dubbio ho provato a disattivarle: il problema rimane, quando il puntatore del mouse mostra l'animazione di "attesa", flickera... come un animazione senza il double buffering attivato insomma O_ò

Quando do il comando sudo nvidia-glx-settings enable mi da
sudo: nvidia-glx-settings: command not found

nel dubbio... la mia versione del pacchatto nvidia-glx è 1.0.8776 + 2.6.17.7-10.1

ti allego il mio xorg.conf... magari tu riesci a capire se c'è qualche errore

No ti ho dato il comando sbagliato, mea culpa,era sudo nvidia-glx-config enable.
Dal tuo xorg.conf, ho visto nella sezione device che manca la scheda video che hai, c'è una generica.
Guarda sulle impostazioni di sistema se ti vede la scheda video che hai.
Prima di abilitare i glx, devi riconfigurare il tuo xorg, facendo sudo dpkg-reconfigure xserver-xorg, e devi mettere la tua scheda video se te la vede, più il ttuo monitor, tastiera ecc..
Sulle impostazioni di sistema del mouse, hai visto se c'erano parametri spuntati per caso che riguardavano appunto questa condizione del puntatore su un'animazione?