Ciao!
Gli altri 'sistemi operativi' che ti compaiono all'accensione del pc sono i vecchi kernel. Quando hai fatto l'aggiornamento, ti ha installato un nuovo kernel; nella lista hai la possibilità di scegliere con quale partire. Il recovery mode, invece dà la possibilità di caricare il s.o. (senza interfaccia grafica) per risolvere errori.
Ho trovato in giro alcune discussioni che riportano problemi analoghi al tuo. Qui
http://swiss.ubuntuforums.org/showthread.php?p=7145609 in particolare si dice che ad un aggiornamento (quindi proprio un caso analogo al tuo), oltre ad uscire questo errore, non vanno più i suoni.
A te succede lo stesso?
Nella stessa discussione si dice che, partendo con un altro kernel (quindi selezionando all'avvio non il primo (ossia quello più recente) kernel, ma un altro, il problema non si presenta.
Prova anche a guardare da gestore pacchetti se è installato jackd.
I hate this stupid machine: it never does what I want, just what I tell it.