Ho usato Xsane praticamente su tutte le distro/versioni, Gnome....Kde, e non ho mai avuto problemi, oltre al fatto che la qualità della scansione è tutt'altro che scarsa (IMHO).
Cmq, esistono varie interfacce e tali rimangono (quiteinsane, flegita, xscanimage, kooka..........) e veri software, come Vuescan, che non necessita d'installazione e riconosce qualsiasi tipo di scanner, anche se non supportato/riconosciuto dal sistema, visto che ha un proprio driver.
Purtroppo a pagamento, ma tutto è possibile.........
Piuttosto, cercherei di risolvere il problema di Xsane: disinstallando Sane e tutto quel che ne consegue, compreso Xsane, pulendo il sistema, riavviandolo e reinstallando ex novo.