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[RISOLTO] Problemi default Java (era: Repository alternativi)
Inviato: giovedì 6 dicembre 2007, 17:19
da Xerses
ciao a tutti!
Sto cercando di installare il software Cytoscape da repository, mi dicono che è presente nei repository per linux, ma in quelli per ubuntu non c'è.
Quali sono questi repository genericamente "per linux" ?
E come faccio ad aggiungerli in Synaptic?
Grazie a chi potrà rispondermi
Re: Repository alternativi
Inviato: giovedì 6 dicembre 2007, 17:38
da ne0h
ubuntu usa quelli di debian. Evidentemente saranno nei repository di distro come suse, mandriva, fedora ecc che usano pacchetti rpm, di conseguenza non si installano in ubuntu in quanto quest'ultimo usa dei formati di pacchetti diversi. Credo che hai capito male. In generale per linux sono i sorgenti, non i repository. Qui ndi quel programma che cerchi, lo devi trovare su google, poi vai sul sito in cui si trova, e ti scarichi i sorgenti, e poi te li compili!
Re: Repository alternativi
Inviato: giovedì 6 dicembre 2007, 17:46
da Actam
Re: Repository alternativi
Inviato: giovedì 6 dicembre 2007, 18:17
da Xerses
Ok, sono riuscito a scaricare un archivio compresso, ed a decompattarlo.
L'ho messo in /usr/lib/, è la directory giusta per un'applicazione di questo tipo?
Per farlo partire c'è un file .sh, che però da solo non funziona.
Probabilmente mi sono perso qualche comando da eseguire.
come si fa ad eseguire un comando .sh?
Re: Repository alternativi
Inviato: giovedì 6 dicembre 2007, 20:18
da Shaved
Premetto che non conosco questo programma, ma se lo scarichi da
http://www.cytoscape.org/download.php (opzione 1) ottieni un file con estensione .sh.
Per installarlo dovrebbe bastare scrivere sul terminale
dove
nome_file.sh è il nome del file che hai scaricato.
Ciao
Re: Repository alternativi
Inviato: giovedì 6 dicembre 2007, 20:31
da ne0h
la cartella del pacchetto che hai scompattato, devi metterla nella tua cartella home e poi dai il comando che ti ha detto shaved, oppure questo:
a volte funziona questo e non quello di shaved, o viceversa. in ogni caso nella cartella in questione dovrebbe esserci un file readme in cui solitamente viene spiegato come si installa tale pacchetto!
Re: Repository alternativi
Inviato: venerdì 7 dicembre 2007, 9:21
da Xerses
ne0h ha scritto:
la cartella del pacchetto che hai scompattato, devi metterla nella tua cartella home e poi dai il comando che ti ha detto shaved, oppure questo:
a volte funziona questo e non quello di shaved, o viceversa. in ogni caso nella cartella in questione dovrebbe esserci un file readme in cui solitamente viene spiegato come si installa tale pacchetto!
L'ho provato, ma il risultato è il seguente:
Codice: Seleziona tutto
Exception in thread "main" java.awt.AWTError: Cannot load AWT toolkit: gnu.java.awt.peer.gtk.GtkToolkit
at java.awt.Toolkit.getDefaultToolkit(libgcj.so.70)
at com.jgoodies.looks.LookUtils.isLowResolution(LookUtils.java:480)
at com.jgoodies.looks.LookUtils.<clinit>(LookUtils.java:249)
at java.lang.Class.initializeClass(libgcj.so.70)
at cytoscape.CyMain.setupLookAndFeel(CyMain.java:250)
at cytoscape.CyMain.parseCommandLine(CyMain.java:216)
at cytoscape.CyMain.<init>(CyMain.java:135)
at cytoscape.CyMain.main(CyMain.java:110)
Caused by: java.lang.UnsatisfiedLinkError: libgtkpeer: libgtkpeer.so: cannot open shared object file: No such file or directory
at java.lang.Runtime._load(libgcj.so.70)
at java.lang.Runtime.loadLibrary(libgcj.so.70)
at java.lang.System.loadLibrary(libgcj.so.70)
at gnu.java.awt.peer.gtk.GtkToolkit.<clinit>(libgcj.so.70)
at java.lang.Class.initializeClass(libgcj.so.70)
at java.lang.Class.forName(libgcj.so.70)
at java.awt.Toolkit.getDefaultToolkit(libgcj.so.70)
...7 more
Come risolvere? ???
Re: Repository alternativi
Inviato: venerdì 7 dicembre 2007, 12:17
da Shaved
A occhio c'è qualcosa che non va con java. Se lo hai già installato lancia il comando
P.S. Sarebbe opportuno cambiare il titolo del topic
Ciao
Re: Repository alternativi
Inviato: venerdì 7 dicembre 2007, 15:43
da Xerses
Shaved ha scritto:
A occhio c'è qualcosa che non va con java. Se lo hai già installato lancia il comando
P.S. Sarebbe opportuno cambiare il titolo del topic
Ciao
(good)
Grazie grazie grazie!
Era esattamente quello di cui avevo bisogno!
Dopo il comando ecco cosa mi è comparso:
Codice: Seleziona tutto
Ci sono 4 alternative che forniscono `java'.
Selezione Alternativa
-----------------------------------------------
1 /usr/bin/gij-wrapper-4.1
*+ 2 /usr/lib/jvm/java-gcj/jre/bin/java
3 /usr/lib/jvm/java-6-sun/jre/bin/java
4 /usr/bin/java-sablevm
Premi invio per mantenere il default[*], o inserisci il numero da selezionare:3
Il 2 era il Java già presente in Ubuntu, che evidentemente non funziona al meglio, mentre il 3 è quello che io ho installato. Ho cambiato il default, dato
e il gioco è stato fatto!
Davvero grazie mille, mi hai risolto un bel problema.
(b2b)