gksu e pannello laterale

[Fochetta]

Ho un piccolo problema con il comando gksu e il pannello laterale:
se lancio un'applicazione che necessita di gksu (che so synaptic per esempio) dal pannello laterale mi blocca tutto, se invece lo lancio da terminale si avvia normalmente.
Come faccio a capire di cosa si tratta?

[Devi]

Prova con gksudo, io lo uso e mai avuto problemi...

[Fochetta]

Anche con gksudo ho lo stesso problema.
Fino a ieri andava tutto bene, ma dopo aver aggiornato - non ricordo più quali pacchetti (ricordo solo compiz, dai repo di Janvitus, e Automatix) - tutte le applicazioni avviate in modalità grafica con i permessi di root bloccano il sistema.