potresti mettere in blacklist i moduli della scheda wifi (e del bluetooth magari) in modo tale da evitare che ubuntu li carichi all'avvio del pc.
quando ti dovessero servire, li puoi caricare con modprobe.
potresti fare uno script per farlo in automantico così da non dover digitare nulla nel terminale (se non la password per sudo)
per una intel ipw2200 ad esempio sarebbe
per disattivare
per attivare
potresti chiamare il file per spegnere il wifi "intel-down.sh", dargli i permessi di esecuzione (chmod +x intel-down.sh) e quindi creare un lanciatore nel pannello con il comando "gksu /percorso/per/intel-down.sh"
idem per l'altro
però mi sembra strano che disattivando la scheda da network manager questa si riaccenda da sola ::)
God is real, unless declared integer.